جمهوری اسلامی ایران به دلیل آنچه همکاری و همراهی دولت بحرین با رژیم صهیونیستی خوانده، به تندی از مسئولان این کشور انتقاد کرده است. حسین امیرعبداللهیان، وزیر امور خارجه جمهوری اسلامی در همین راستا در توئیتر خود نوشت: « استقبال حکومت بحرین از وزیر خارجه رژیم جعلی صهیونیستی، خیانت آشکار به آرمان مردم مظلوم و مقاوم فلسطین است. ما فقط یک کشور می شناسیم که فلسطین نام دارد و پایتخت آن قدس است. بی تردید ارمغان تل آویو برای منطقه ‌و بحرین تنها ناامنی است.» سعید خطیب‌زاده، سخنگوی وزارت امور خارجه ایران نیز طی اظهاراتی در مورد سفر وزیر خارجه رژیم صهیونیستی به بحرین، با یادآوری اقدام خفت بار حاکمان بحرین در علنی سازی روابط با رژیم صهیونیستی، استقبال حقیرانه حاکمان این کشور از مقام رژیم اشغالگر قدس را خلاف خواست و رای مردم شریف و آزاده بحرین خواند. سخنگوی وزارت امور خارجه هر گونه زمینه سازی برای تثبیت حضور مخرب اسرائیل در منطقه را در راستای تنش زایی و ناامنی بیشتر دانست و آن را محکوم کرد.