پیش از ساعت هشت و نیم صبح، خودروی حامل پیکرها از یکی از خیابان‌های منتهی به خیابان آزادی وارد جمعیت انبوه عزاداران شد. پس از ورود خودرو، سردار حسن‌زاده، رئیس قرارگاه برگزاری آئین وداع، نماز و تشییع پیکر رهبر شهید در تهران، خطاب به مردم گفت که در مسیر تشییع بمانند، چرا که پیکر مطهر رهبر شهید در پایان مراسم بار دیگر با بالگرد از همان مسیر عبور داده خواهد شد.

با نزدیک‌شدن خودروی حامل پیکر مطهر شهدا به حوالی میدان آزادی، این خودرو برای رسیدن سایر عزاداران در همان محل متوقف شد و حدود ساعت یازده و نیم، با مشایعت انبوه مردم، وارد میدان آزادی شد.

سردار حسن‌زاده حدود ساعت یک و نیم بعدازظهر اعلام کرد که خودروی حامل پیکرهای مطهر طی ساعات بعد، بزرگراه شهید لشگری را طی خواهد کرد و ابراز امیدواری کرد که مراسم تا چند ساعت بعد به نقطه پایانی خود برسد. او همچنین با اشاره به حضور حماسی و بی‌سابقه مردم در تهران، از تغییرات ناگزیری که در مسیر مراسم و مدیریت میدانی این رویداد اعمال شده بود، سخن گفت و افزود که برنامه‌ریزی شده بود مراسم تشییع در تهران پیش از ساعت ۱۷ به پایان برسد تا پیکرهای مطهر پیش از اذان مغرب به شهر قم منتقل شوند.

ساعت‌ها پیش از آغاز مراسم، مسیر اصلی تشییع و خیابان‌های منتهی به آن مملو از جمعیتی بود که در سوگ فقدان رهبر شهید، لباس مشکی بر تن کرده بودند و تصاویری از ایشان، همراه با پرچم ایران و پرچم‌های قرمز، در دست داشتند. عزاداران اشک می‌ریختند و با مشت‌های گره‌کرده بر سینه، بر عهد خود با رهبری شهید تأکید می‌کردند. همزمان با آغاز مراسم تشییع در میدان امام حسین(ع)، سرود ملی ایران پخش شد و عزاداران آن را همخوانی کردند.

در این مراسم، علاوه بر شهروندان تهرانی، مردم از استان‌های مختلف کشور و همچنین برخی کشورهای دیگر خود را به پایتخت رسانده بودند تا در بدرقه «آقای شهید ایران» شرکت کنند. «ای اهل حرم میر و علمدار نیامد» و «عزا عزاست امروز، روز عزاست امروز/ خامنه‌ای شهید، پیش خداست امروز» از جمله شعارهایی بود که عزاداران سر می‌دادند. آن‌ها همچنین شعار «ای رهبر شهیدم راهت ادامه دارد، ای پدر شهیدم راهت ادامه دارد» را فریاد می‌زدند.

علاوه بر حضور گسترده مردم عزادار از اقصی‌نقاط ایران، تعدادی از مقامات و شخصیت‌های کشور نیز در مراسم تشییع رهبر شهید حضور یافتند.صادق آملی لاریجانی، رئیس مجمع تشخیص مصلحت نظام؛ مسعود پزشکیان، رئیس‌جمهور؛ غلامحسین محسنی‌اژه‌ای، رئیس قوه قضاییه؛ عارف، معاون اول رئیس‌جمهور؛ سردار قاآنی؛ سید عباس عراقچی، وزیر امور خارجه؛ فاطمه مهاجرانی، سخنگوی دولت؛ آیت‌الله احمد جنتی، دبیر شورای نگهبان؛ و سید عباس صالحی، وزیر فرهنگ، از جمله حاضران در این مراسم بودند.

سید علی مدنی‌زاده، وزیر اقتصاد؛ حمیدرضا حاجی‌بابایی، نایب‌رئیس مجلس؛ اسحاق جهانگیری، معاون اول رئیس‌جمهور پیشین؛ حجت‌الاسلام‌ علی کمساری، رئیس مؤسسه تنظیم و نشر آثار امام خمینی (ره)؛ مسعود حبیبی، معاون فرهنگی و دانشجویی وزارت بهداشت؛ مهدی تاج، رئیس فدراسیون فوتبال؛ الیاس حضرتی، رئیس شورای اطلاع‌رسانی دولت؛ و احمد می‌دری، وزیر تعاون، کار و رفاه اجتماعی نیز در جمع عزاداران دیده شدند.

همچنین محمد اسلامی، رئیس سازمان انرژی اتمی ایران؛ زهرا بهروزآذر، معاون رئیس‌جمهور در امور زنان و خانواده؛ رضا صالحی امیری، وزیر میراث‌فرهنگی و گردشگری؛ احمد دنیامالی، وزیر ورزش و جوانان؛ فرزانه صادق، وزیر راه؛ محسن پاک‌نژاد، وزیر نفت؛ محمد اتابک، وزیر صنعت، معدن و تجارت؛ اسکندر مومنی، وزیر کشور؛ حسین دهقان، رئیس بنیاد مستضعفان انقلاب اسلامی؛ سید ستار هاشمی، وزیر ارتباطات و فناوری؛ سید احمد خمینی، فرزند سید حسن خمینی؛ و عبدالناصر همتی، رئیس‌کل بانک مرکزی، از دیگر مقاماتی بودند که در این مراسم حضور یافتند.