یکی از خانه‌های تاریخی نایین به‌تازگی به‌دست مالک آن و بدون مجوز اداره میراث فرهنگی این شهرستان تخریب شده است. بااین‌حال، ماجرا تنها به یک خانه محدود نمی‌شود. بافت تاریخی این شهر به‌مرور چنان تخریب شده که در بسیاری از نقاط، اثری از ساختار قدیمی آن باقی نمانده است. گویی مسئولان شهری، کسبه و مالکان خانه‌های تاریخی دست‌به‌دست هم داده‌اند تا چیزی به نام بافت تاریخی در این شهر زیبای کویری باقی نماند. بازار قدیمی و برخی آثار معروف و ارزشمند هنوز پابرجایند، اما بخش‌های گسترده‌ای از بافت تاریخی تخریب شده است. رئیس اداره میراث فرهنگی نایین از مرمت و حفاظت بازار تاریخی این شهر خبر می‌دهد، اما درباره علت تخریب گسترده بافت تاریخی اطراف بازار توضیحی نمی‌دهد.