پمپ بیولوژیک اقیانوس یکی از مهم‌ترین سازوکارهای طبیعی برای انتقال کربن از سطح آب به اعماق دریاست. فیتوپلانکتون‌ها، زئوپلانکتون‌ها، برف دریایی، پلت‌های مدفوعی و مواد معدنی سنگین در این چرخه نقش دارند؛ چرخه‌ای که با گرمایش آب‌ها، اسیدی شدن اقیانوس‌ها و تغییر ترکیب جوامع دریایی تحت فشار قرار گرفته است.