مدیریت پسماندهای عفونی و بیمارستانی در کرج به یکی از دغدغه‌های اصلی مدیریت شهری تبدیل شده است. ابهام در تفکیک وظایف قانونی میان شهرداری و مراکز درمانی برای بی‌خطرسازی و دفع این پسماندها، علاوه بر تحمیل هزینه‌های سنگین به سایت حلقه‌دره، سلامت عمومی و محیط زیست را با چالش‌های جدی روبه‌رو کرده است.